Foi um tribunal criado pela Igreja Católica no século XIII para perseguir, julgar e punir os acusados de heresia. Herege eram as pessoas que seguisse doutrinas ou práticas contrárias às definidas pela Igreja. Quando o cristianismo se tornou a religião oficial do Império Romano no século IV, os hereges eram perseguidos como inimigos do Estado.

Entre os séculos XI e XV na Europa, o desenvolvimento da cultura e da filosofia produziram conhecimentos contrários às idéias sobre o mundo definidas até então pelos religiosos. Ao mesmo tempo, eclodiram movimentos cristãos em Lyon e Albi, na França, que pregavam a volta do cristianismo às origens, defendendo a necessidade de a Igreja abandonar suas riquezas.

Mas como respostas a essas heresias, milhares de albigenses foram mortos, entre 1208 e1229. Dois anos depois foi criada a Inquisição. Já nos séculos XVI e XV, os tribunais da Inquisição diminuíram suas atividade e foram recriados sob a forma de uma Congregação da Inquisição, popularmente conhecida como Santo Ofício.

Passaram a combater os movimentos da Reforma Protestante e as heresias filosóficas e científicas nascidas no renascimento.

Idade Média